RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.99□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.99□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0J9YY10 115 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 OR51F1A6NGY5 319 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ISM1B1AKI9 464 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 MASP2O00187 686 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 PEX12O00623 359 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 AP2A2O94973 939 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 METTL18O95568 372 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FTH1P02794 183 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CTSBP07858 339 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 GSTM1P09488 218 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 NSG1P42857 185 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FOXL2P58012 376 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 GSTM4Q03013 218 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SSPNQ14714 243 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ZIC1Q15915 447 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 PARP6Q2NL67 630 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 KCTD11Q693B1 232 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 IQCKQ8N0W5 287 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 STYXQ8WUJ0 223 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM5Q9C035 493 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 C5AR2Q9P296 337 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.98□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 MED13Q9UHV7 2174 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 H3BMH7 237 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 QSOX1O00391 747 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TPBGLP0DKB5 382 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ACADLP28330 430 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 GABRA4P48169 554 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ITIH4Q14624 930 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 DCAF10Q5QP82 559 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 GALNT16Q8N428 558 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ALG3Q92685 438 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 IP6K3Q96PC2 410 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 GBP5Q96PP8 586 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 NDC1Q9BTX1 674 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 POLG2Q9UHN1 485 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 RELNP78509 3460 aa9.97□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.96□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.96□□□□□ -0.81
CLRN3-201ENST00000368671 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 PSMD3O43242 534 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 KDM1AO60341 852 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 AP2A1O95782 977 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 DDAH2O95865 285 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 IGHEP01854 428 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 ALPPP05187 535 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 CD63P08962 238 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 OR56A5P0C7T3 313 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 COL8A1P27658 744 aa9.96□□□□□ -0.82
CLRN3-201ENST00000368671 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms