RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 DUSP7Q16829 419 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 AAK1Q2M2I8 961 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 NACC2Q96BF6 587 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 TSGA13Q96PP4 275 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 PHOX2BQ99453 314 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 VNN3Q9NY84 501 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 STMN3Q9NZ72 180 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 VAPAQ9P0L0 249 aa16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
GDE1-201ENST00000353258 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 OR4Q2P0C623 313 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ODC1P11926 461 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CTSKP43235 329 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 STARD3Q14849 445 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 RNF170Q96K19 258 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 GDF15Q99988 308 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D24Q9ULP9 559 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 A0A0X1KG70 313 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 F9P00740 461 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PPP3CCP48454 512 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 AIF1P55008 147 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 RANBP10Q6VN20 620 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SYVN1Q86TM6 617 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 AADATQ8N5Z0 425 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 UBE2FQ969M7 185 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 NCLNQ969V3 563 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 MKLN1Q9UL63 735 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 Q9Y3F1 56 aa16.45■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 S1PR4O95977 384 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CYP2A7P20853 494 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 GRK5P34947 590 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 MAP6Q96JE9 813 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SNX4O95219 450 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DQB2P05538 268 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 EPHA2P29317 976 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ARSDP51689 593 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SLAMF1Q13291 335 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PWP1Q13610 501 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CHPFQ8IZ52 775 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 OR5H6Q8NGV6 325 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 Q96MT0 163 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZNF599Q96NL3 588 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 MYOCQ99972 504 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 RUBCNLQ9H714 662 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZNF225Q9UK10 706 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 M0R082 166 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CXCR6O00574 342 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CDONQ4KMG0 1287 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 HORMAD1Q86X24 394 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 METTL23Q86XA0 190 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ADAM2Q99965 735 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PCM1Q15154 2024 aa16.43■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 YES1P07947 543 aa16.43■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 KEAP1Q14145 624 aa16.43■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 PON2Q15165 354 aa16.43■□□□□ 0.22
GDE1-201ENST00000353258 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms