RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD17B2P37059 387 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC1A6P48664 564 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCN2Q14257 317 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.863e-8■■■■■ 157.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC23A3Q6PIS1 610 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGTRAPQ6RW13 159 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYTL1Q8IYJ3 562 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBTD2Q8WUN7 234 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ESAMQ96AP7 390 aa26.66■■□□□ 1.86
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD244Q9BZW8 370 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP1Q9NVV9 213 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPTCQ9UBM4 332 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 YKT6O15498 198 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAPBPO15533 448 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPA4LO95757 839 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 VIPP01282 170 aa26.65■■□□□ 1.86
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CBX1P83916 185 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC50Q53HI1 259 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRC3Q9H069 523 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa26.65■■□□□ 1.86
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSS2Q9NR19 701 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA7Q9P0W8 599 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC14BA6NHZ5 514 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC19A1P41440 591 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-BQ31612 363 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9B2Q86UD5 537 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 AVL9Q8NBF6 648 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6Y1Q8NGX8 325 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK15Q8TD08 544 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP6Q96FZ7 201 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED8Q96G25 268 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM79Q9BSE2 394 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMOQ9BU70 441 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATG10Q9H0Y0 220 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLAGL1Q9UM63 463 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 PATE3B3GLJ2 98 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS17P08708 135 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 IMPA1P29218 277 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIK3CGP48736 1102 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNLIPRP1P54315 467 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 BIRC2Q13490 618 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAE1Q13564 534 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP19Q14CB8 494 aa26.64■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LAIR1Q6GTX8 287 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMD7Q6ZUT3 714 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM47EQ6ZV65 393 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF480Q8WV37 535 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOCOSQ96EN8 888 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC32A1Q9H598 525 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSCN3Q9NQT6 498 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 POT1Q9NUX5 634 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPNE7Q9UBL6 633 aa26.64■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GTQ1 180 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GMNCA6NCL1 334 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7EPI3 171 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR47O94967 919 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CER1O95813 267 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 BNIP3Q12983 259 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAGSQ8N159 534 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFRP1Q8N474 314 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC37A2Q8TED4 501 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 PITPNM3Q9BZ71 974 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTO2Q9H4Y5 243 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAREM1Q9H706 876 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCTPQ9UKL6 214 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 E2F3O00716 465 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP33O14559 1287 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIPC1O14908 333 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNNO75324 88 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF5P43026 501 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDH13P55290 713 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLCQ05315 142 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2H2Q13888 395 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRB7Q14451 532 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBBP7Q16576 425 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa26.62■■□□□ 1.85
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