RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 DOK6Q6PKX4 331 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RNF165Q6ZSG1 346 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ROPN1LQ96C74 230 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 COX14Q96I36 57 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PKP4Q99569 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 LGR4Q9BXB1 951 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZIM2Q9NZV7 527 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 AP1G1O43747 822 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 VEGFDO43915 354 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 BAG2O95816 211 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC138Q96M89 665 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 FOPNLQ96NB1 174 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PP18 115 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ASPDHA6ND91 283 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM38O00635 465 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A8O95907 504 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PDYNP01213 254 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CTHP32929 405 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NEK2P51955 445 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 FLOT2Q14254 428 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NFE2L1Q14494 772 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 IMPG1Q17R60 797 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CYP20A1Q6UW02 462 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT8Q8WV74 236 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ACTL8Q9H568 366 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf105O95561 183 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KRT6AP02538 564 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KRT6BP04259 564 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KRT6CP48668 564 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NAE1Q13564 534 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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VSTM4-201ENST00000298454 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KBTBD6Q86V97 674 aa22.15■■□□□ 1.14
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VSTM4-201ENST00000298454 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MED8Q96G25 268 aa22.15■■□□□ 1.14
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VSTM4-201ENST00000298454 GPR34Q9UPC5 381 aa22.15■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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VSTM4-201ENST00000298454 EGFP01133 1207 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 IMPA1P29218 277 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 GCKP35557 465 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 HALP42357 657 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A2P52569 658 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T3Q8NH03 318 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TSPEARQ8WU66 669 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ACPTQ9BZG2 426 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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VSTM4-201ENST00000298454 ACOT8O14734 319 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K7O43318 606 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 NTSR1P30989 418 aa22.14■■□□□ 1.13
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VSTM4-201ENST00000298454 CDK3Q00526 305 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CHIT1Q13231 466 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PAGE3Q5JUK9 113 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR2L2Q8NH16 312 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ATL1Q8WXF7 558 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 KLK6Q92876 244 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.14■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FAM234BA2RU67 622 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PRR23AA6NEV1 266 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FXYD1O00168 92 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD28O15084 1053 aa22.13■■□□□ 1.13
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