RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ENPP2Q13822 863 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PTK2BQ14289 1009 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS6KA2Q15349 733 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGGQ5H8A4 983 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CNSTQ6PJW8 725 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CHSY3Q70JA7 882 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CUZD1Q86UP6 607 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HPS6Q86YV9 775 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP97Q8IW35 865 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LSMEM2Q8N112 164 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AGR3Q8TD06 166 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DDI1Q8WTU0 396 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC10Q969S8 669 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT7Q99832 543 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CIPCQ9C0C6 399 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MUC13Q9H3R2 512 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NMUR1Q9HB89 426 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GID8Q9NWU2 228 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MARK1Q9P0L2 795 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CROTQ9UKG9 612 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LRBAP50851 2863 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SUV39H1O43463 412 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DFNA5O60443 496 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TLR5O60602 858 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CSO75390 466 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFS3O75489 264 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN11O75508 207 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CRCPO75575 148 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SBK3P0C264 359 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LINGO3P0C6S8 592 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM87AP0C7U9 286 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CR2P20023 1033 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TACR2P21452 398 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FDXRP22570 491 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PAX7P23759 505 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ARNTP27540 789 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1E1P30953 314 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GPC1P35052 558 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD8P48556 350 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CHN2P52757 468 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH4P55283 916 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB15P59190 212 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HERVK_113P63132 956 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ACVR1Q04771 509 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SULT2A1Q06520 285 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXM1Q08050 763 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DLG1Q12959 904 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ILKQ13418 452 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP7Q14244 749 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00303Q3SY05 128 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AGKQ53H12 422 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL22Q6P050 247 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR3DQ70Z44 454 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.9□□□□□ -1.3
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