RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 YIPF1Q9Y548 306 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SCN1AP35498 2009 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 AP2A2O94973 939 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 UGT1A4P22310 534 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 UGT1A3P35503 534 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 UGT1A5P35504 534 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IL37Q9NZH6 218 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 H7C0S8 307 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 I6L893 689 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NOBOXO60393 691 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DLGAP3O95886 979 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GNRH1P01148 92 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CDK4P11802 303 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CXCR2P25025 360 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CSNK1DP48730 415 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA6Q15825 494 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 XKR7Q5GH72 579 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CLN6Q9NWW5 311 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KRT78Q8N1N4 520 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 SGK2Q9HBY8 427 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PLXNB2O15031 1838 aa8.65□□□□□ -1.02
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HERC3-201ENST00000264345 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.65□□□□□ -1.03
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HERC3-201ENST00000264345 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DET1Q7L5Y6 550 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CPQQ9Y646 472 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 LRATO95237 230 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IGLV3-27P01718 113 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GALTP07902 379 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ALPIP09923 528 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CCDC159P0C7I6 412 aa8.64□□□□□ -1.03
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