RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 PEX13Q92968 403 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SGSM3Q96HU1 749 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CARD6Q9BX69 1037 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 RELNP78509 3460 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 A6NL46 340 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 H3BMH7 237 aa20.31■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.31■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.3■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 NUDT9Q9BW91 350 aa20.3■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.3■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 C5AR2Q9P296 337 aa20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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NEDD8-201ENST00000250495 APRTP07741 180 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 ETS1P14921 441 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CDC25BP30305 580 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PKLRP30613 574 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SNX1Q13596 522 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PCID2Q5JVF3 399 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 FHL5Q5TD97 284 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SPC24Q8NBT2 197 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PTERQ96BW5 349 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 CD9P21926 228 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 GNLYP22749 145 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 TTPAP49638 278 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA3AQ14563 771 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 TMED2Q15363 201 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-201ENST00000250495 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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