RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237380.11

MED28-201, Transcript of mediator complex subunit 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MED28, Length 10,868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28-201ENST00000237380 VIPR1P32241 457 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CLRN1P58418 232 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 MAMLD1Q13495 774 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SYT17Q9BSW7 474 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PIF1Q9H611 641 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 GPR25O00155 361 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PPEF2O14830 753 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 RAB36O95755 333 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 FOXN2P32314 431 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CYP4F2P78329 520 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CYP4F3Q08477 520 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SCGB2A2Q13296 93 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 BRF2Q9HAW0 419 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PIGNO95427 931 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 FABP3P05413 133 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TIE1P35590 1138 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PGDP52209 483 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 KCNN1Q92952 543 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 OR2AG1Q9H205 316 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SYT4Q9H2B2 425 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 B4DGG1 531 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SERPINA6P08185 405 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 DNAJB1P25685 340 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 GABRB2P47870 512 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TTC34A8MYJ7 566 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SPATS1Q496A3 300 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TIGD4Q8IY51 512 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 COQ8BQ96D53 544 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 HDAC3O15379 428 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 AP2A2O94973 939 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 METTL18O95568 372 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 BGNP21810 368 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 NAGLUP54802 743 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TAS2R43P59537 309 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SP140Q13342 867 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TMIEQ8NEW7 156 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SLC34A1Q06495 639 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 IRF5Q13568 498 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SMPDL3BQ92485 455 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 RBP7Q96R05 134 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PRRX2Q99811 253 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CDC7O00311 574 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ELNP15502 786 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 THBS2P35442 1172 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SLC6A9P48067 706 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 MOGQ16653 247 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 C5orf22Q49AR2 442 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 SFRP1Q8N474 314 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 IL31RAQ8NI17 732 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ZNF358Q9NW07 568 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 PTGES3LE9PB15 166 aa7.28□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 KDM4BO94953 1096 aa7.28□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 ITGA3P26006 1051 aa7.28□□□□□ -1.24
MED28-201ENST00000237380 GRIA2P42262 883 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms