RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 LINC01565O15544 149 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ATP6V1B1P15313 513 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ATP6V1B2P21281 511 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SLC7A9P82251 487 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 B4GALNT1Q00973 533 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FOLH1Q04609 750 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 MED21Q13503 144 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TCEA2Q15560 299 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 BCL2A1Q16548 175 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 USP45Q70EL2 814 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SCAIQ8N9R8 606 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 IGFLR1Q9H665 355 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CCDC154A6NI56 674 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 H3BUI4 141 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LYNP07948 512 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 UROSP10746 265 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 VCLP18206 1134 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 WASP42768 502 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PREPP48147 710 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RELAQ04206 551 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 IMPG1Q17R60 797 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LIN52Q52LA3 116 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CARD16Q5EG05 197 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ANKRD46Q86W74 232 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PDSS2Q86YH6 399 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 STK40Q8N2I9 435 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ACTR8Q9H981 624 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OPTCQ9UBM4 332 aa9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SLC22A3O75751 556 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GSNP06396 782 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RPIAP49247 311 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ADAM15Q13444 863 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 C12orf40Q86WS4 652 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 DHFR2Q86XF0 187 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CMTM6Q9NX76 183 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 AP4S1Q9Y587 144 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 A0A1B0GTW7 788 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TNFRSF10AO00220 468 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SEC22BO75396 215 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 MLYCDO95822 493 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FGF4P08620 206 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 C1SP09871 688 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PTPN2P17706 415 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 HERC3Q15034 1050 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TLR1Q15399 786 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SPERTQ8NA61 448 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 SCRN2Q96FV2 425 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 PRR23AA6NEV1 266 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GFRA2O00451 464 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CDK2AP1O14519 115 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ARHGAP33O14559 1287 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 KCNJ13O60928 360 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 STAMBPO95630 424 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 DGKAP23743 735 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 OXTRP30559 389 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CDKL1Q00532 357 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.74□□□□□ -0.85
USP11-201ENST00000218348 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms