RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXM1Q08050 763 aa16.77■□□□□ 0.28
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RABGGTA-201ENST00000216840 GTF2H3Q13889 308 aa16.77■□□□□ 0.28
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RABGGTA-201ENST00000216840 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
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RABGGTA-201ENST00000216840 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
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RABGGTA-201ENST00000216840 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
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RABGGTA-201ENST00000216840 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.77■□□□□ 0.27
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RABGGTA-201ENST00000216840 ATP6V1C1P21283 382 aa16.76■□□□□ 0.27
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RABGGTA-201ENST00000216840 MTHFRP42898 656 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NEK2P51955 445 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 SEC13P55735 322 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CHIT1Q13231 466 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 AAK1Q2M2I8 961 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf109Q9NX04 203 aa16.76■□□□□ 0.27
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