RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SUPT7L	O94864	414 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RHO	P08100	348 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	EPCAM	P16422	314 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	AVPR1A	P37288	418 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ACVR1	Q04771	509 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PLCL1	Q15111	1095 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TEAD2	Q15562	447 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CRY1	Q16526	586 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CYP51A1	Q16850	503 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ERAP2	Q6P179	960 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RMDN1	Q96DB5	314 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MUS81	Q96NY9	551 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARPC2	O15144	300 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	XYLB	O75191	536 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CYBB	P04839	570 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SBK3	P0C264	359 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	THRB	P10828	461 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ELK4	P28324	431 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GMPR	P36959	345 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARSD	P51689	593 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF544	Q6NX49	715 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	APCDD1	Q8J025	514 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARL5A	Q9Y689	179 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	UBXN8	O00124	270 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RAD51B	O15315	384 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DLX3	O60479	287 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PRL	P01236	227 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PIRT	P0C851	137 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCA	P17252	672 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SAT1	P21673	171 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NR4A2	P43354	598 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RHOA	P61586	193 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LMAN2	Q12907	356 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DAG1	Q14118	895 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT7	Q86SF2	657 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PROSER1	Q86XN7	944 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TBATA	Q96M53	351 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TRMO	Q9BU70	441 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DSN1	Q9H410	356 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCL26	Q9Y258	94 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCL22	O00626	93 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TULP3	O75386	442 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCNK	O75909	580 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC159	P0C7I6	412 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	IST1	P53990	364 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ARSF	P54793	590 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DEFA1	P59665	94 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DEFA3	P59666	94 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RAB10	P61026	200 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF566	Q969W8	418 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		15	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		15	□□□□□ -0.01

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