RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP2Q99490 1192 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 IL25Q9H293 177 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 VWA7Q9Y334 891 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DISC1C4P0D8 188 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HCRTR2O43614 444 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ADH1CP00326 375 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 VTNP04004 478 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ARL9Q6T311 187 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GPR135Q8IZ08 494 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BRD9Q9H8M2 597 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BTRCQ9Y297 605 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPA8P0DM63 369 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAP3K8P41279 467 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GRK6P43250 576 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC15A1P46059 708 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FCGRTP55899 365 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SEZ6Q53EL9 994 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB106AQ8N104 65 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ACBD4Q8NC06 268 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PPM1MQ96MI6 270 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 EPYCQ99645 322 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ELP3Q9H9T3 547 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ENTPD6O75354 484 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLITRK3O94933 977 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PORCNQ9H237 461 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LHX5Q9H2C1 402 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TMX2Q9Y320 296 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KHKP50053 298 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2A2P52657 109 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NCS1P62166 190 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CD47Q08722 323 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC32Q9BV29 185 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ASB8Q9H765 288 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf109Q9NX04 203 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 TBX1O43435 398 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 CLCN3P51790 818 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PRKCDQ05655 676 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C4orf17Q53FE4 359 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AADACL2Q6P093 401 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCD2Q92925 531 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ASB9Q96DX5 294 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ABCB9Q9NP78 766 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 IFNA5P01569 189 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NR4A2P43354 598 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NME7Q9Y5B8 376 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CDC7O00311 574 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NFKB2Q00653 900 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf80Q0P641 193 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 OGFOD2Q6N063 350 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MRI1Q9BV20 369 aa6.86□□□□□ -1.31
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