RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 WASF3Q9UPY6 502 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LMO7DNF2Z398 122 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF11O14901 512 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF30P17039 623 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDH4A1P30038 563 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 AQP5P55064 265 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CES3Q6UWW8 571 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 RANBP10Q6VN20 620 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 USP53Q70EK8 1073 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAAF3Q8N9W5 541 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CLPTM1LQ96KA5 538 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEE1Q9HCI5 957 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNK4Q9NYG8 393 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQ67 120 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ADRA1AP35348 466 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 GEMP55040 296 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MXRA7P84157 204 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 NKAIN2Q5VXU1 208 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC5AQ6ZN44 842 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDCD3Q8IVD9 361 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MPP5Q8N3R9 675 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 OXR1Q8N573 874 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM136AQ96C01 138 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 C7orf26Q96N11 449 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 VAT1Q99536 393 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf27Q9GZN8 174 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 NLGN3Q9NZ94 848 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 STX7O15400 261 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 SGTAO43765 313 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 RFPL3O75679 317 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ANXA9O76027 345 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 NFKBIAP25963 317 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD17B7P56937 341 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 OCRLQ01968 901 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 SGF29Q96ES7 293 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LYSMD1Q96S90 227 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 FERMT1Q9BQL6 677 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDM8Q9NQV8 689 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 TAAR2Q9P1P5 351 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMD13Q9UNM6 376 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 KALRNO60229 2985 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPN14A8MX76 684 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 INMTO95050 263 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PRAMEF1O95521 474 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSCP53634 463 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL26P61254 145 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PRPSAP1Q14558 356 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 AGERQ15109 404 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOCQ15369 112 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 INAVAQ3KP66 663 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LGSNQ5TDP6 509 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ATG16L1Q676U5 607 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPK15Q8TD08 544 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 NRTNQ99748 197 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 IL17CQ9P0M4 197 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF180Q9UJW8 692 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PADI4Q9UM07 663 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPRBP23467 1997 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MYLKQ15746 1914 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 HMX2A2RU54 273 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA8TH3BQL2 631 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMD11O00231 422 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK14O94921 469 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MPOP05164 745 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 MSL3P1P0C860 447 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ALPPL2P10696 532 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 HMGCLP35914 325 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 ARSDP51689 593 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1024LP59773 190 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP4F3Q08477 520 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 KBTBD2Q8IY47 623 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 RILPQ96NA2 401 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 EBF4Q9BQW3 602 aa12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms