RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	APC	P25054	2843 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.52	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	SVIL	O95425	2214 aa		11.52	□□□□□ -0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ALOX12B	O75342	701 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CRTAM	O95727	393 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	HBQ1	P09105	142 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGAX	P20702	1163 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	HADHA	P40939	763 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FOLR3	P41439	243 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SSPN	Q14714	243 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	DBN1	Q16643	649 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNN4	O15554	427 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PJA2	O43164	708 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP3K7	O43318	606 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ALPP	P05187	535 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ACADL	P28330	430 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GCGR	P47871	477 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	RPA4	Q13156	261 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZS92	163 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA13	Q96N96	652 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0J9YY10	115 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338		H7C0S8	307 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX12	O00623	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	E2F3	O00716	465 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	RBP3	P10745	1247 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SHMT2	P34897	504 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX8	P57073	446 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	BRD3	Q15059	726 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	HIF1A	Q16665	826 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.5	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms