RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	CCNC	P24863	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CASP6	P55212	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HSF1	Q00613	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RBPJ	Q06330	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TFF3	Q07654	80 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GSE1	Q14687	1217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RBBP7	Q16576	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	AGAP11	Q8TF27	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MATN2	O00339	956 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MED26	O95402	600 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HP	P00738	406 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FOSL1	P15407	271 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DES	P17661	470 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MCM3	P25205	808 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GBE1	Q04446	702 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PRKG2	Q13237	762 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	WDR54	Q9H977	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF358	Q9NW07	568 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ONECUT2	O95948	504 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	COX6A1	P12074	109 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	NDUFS1	P28331	727 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PDHA2	P29803	388 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PCK1	P35558	622 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	OR1D4	P47884	311 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	ARSE	P51690	589 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	KRT33B	Q14525	404 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SYCP1	Q15431	976 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	FATE1	Q969F0	183 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	GPR137	Q96N19	417 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1B0GX78	115 aa		11.59	□□□□□ -0.55
NUP62-216	ENST00000599560	MAP3K7	O43318	606 aa		11.59	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms