RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.32□□□□□ -0.6
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CAPNS1-209ENST00000590049 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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CAPNS1-209ENST00000590049 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.3□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.3□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 AREL1O15033 823 aa11.29□□□□□ -0.6
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