RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SERPINC1P01008 464 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 KRT1P04264 644 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 UGT2B7P16662 529 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ALAS2P22557 587 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 MMP11P24347 488 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CD151P48509 253 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 MPP3Q13368 585 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ART3Q13508 389 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TLR1Q15399 786 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ODF2Q5BJF6 829 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZNF567Q8N184 647 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 LURAP1Q96LR2 239 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 OR2A14Q96R47 310 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NDC1Q9BTX1 674 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 OLAHQ9NV23 265 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NENFQ9UMX5 172 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ICKQ9UPZ9 632 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 HIVEP1P15822 2718 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 C2orf81A6NN90 581 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AGAP14A8MT82 685 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SOCS6O14544 535 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AGTP01019 485 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NR2C2P49116 596 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TMPRSS15P98073 1019 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 XIAPP98170 497 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FCRL6Q6DN72 434 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 RELTQ969Z4 430 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NACC2Q96BF6 587 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 LHPPQ9H008 270 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 A0A0J9YY10 115 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 CFAP99D6REC4 459 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 TNNT1P13805 278 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 PTGER4P35408 488 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 KCNK10P57789 538 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ZBED6P86452 979 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 NXPE1Q8N323 547 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 BCORP1Q8N888 145 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ULK4Q96C45 1275 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 COPS8Q99627 209 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 KLHL18O94889 574 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 SHMT2P34897 504 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 NKG7Q16617 165 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 VAT1Q99536 393 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 FICDQ9BVA6 458 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ZFHX3Q15911 3703 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 C5orf60A6NFR6 353 aa14.68□□□□□ -0.06
IFT20-216ENST00000588477 ISM1B1AKI9 464 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms