RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GNAO1P09471 354 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STAG3L2P0CL84 134 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CALCBP10092 127 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COX5BP10606 129 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BRAFP15056 766 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TCF4P15884 667 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TNNI3P19429 210 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SAT1P21673 171 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C5AR1P21730 350 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GIFP27352 417 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PKLRP30613 574 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 YWHABP31946 246 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SFNP31947 248 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RORAP35398 523 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CD79BP40259 229 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRKCIP41743 596 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CDKN2CP42773 168 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC1A3P43003 542 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CRATP43155 626 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CCR10P46092 362 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FASLGP48023 281 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CSNK1DP48730 415 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PTH2RP49190 550 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SMSP52788 366 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CEBPGP53567 150 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CDH4P55283 916 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AP1S2P56377 157 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1024LP59773 190 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRPS1P60891 318 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ACTR2P61160 394 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TGM3Q08188 693 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FOXI1Q12951 378 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MYO1EQ12965 1108 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLAQ13239 276 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TUBB2AQ13885 445 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CAMK4Q16566 473 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NADK2Q4G0N4 442 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C2CD6Q53TS8 623 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TEX30Q5JUR7 227 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CDKL4Q5MAI5 379 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MANEAQ5SRI9 462 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD17BQ5VST6 288 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC38Q5VT99 294 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SPOPLQ6IQ16 392 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL17Q6TDP4 642 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CES3Q6UWW8 571 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COLCA1Q6ZS62 124 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GDF7Q7Z4P5 450 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GPR141Q7Z602 305 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 USP37Q86T82 979 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM228AQ86W67 206 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00346Q8IVM7 164 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TIGD4Q8IY51 512 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DSELQ8IZU8 1212 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NAGSQ8N159 534 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GHDCQ8N2G8 530 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ELMOD1Q8N336 334 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GPR137CQ8N3F9 429 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL16Q8N461 479 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 WDTC1Q8N5D0 677 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COMMD1Q8N668 190 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF366Q8N895 744 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KDM1BQ8NB78 822 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF248Q8NDW4 579 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STEAP2Q8NFT2 490 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR52N2Q8NGI0 321 aa3□□□□□ -1.93
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