RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAFAH2Q99487 392 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYTL2Q9HCH5 934 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5K3A6NET4 321 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CATP04040 527 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCKBRP32239 447 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHMT2P34897 504 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 INHBCP55103 352 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC29A2Q14542 456 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMIGO1Q86WK6 493 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO1HQ8N1T3 1032 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB11Q8WXH4 323 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINGO1Q96FE5 620 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARD6BQ9BYG5 372 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPB41L4BQ9H329 900 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAB39LQ9H9S4 337 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPAMQ9HCL2 828 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHA6Q9UF33 1036 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK13Q9UKR3 277 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICKQ9UPZ9 632 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 IKBKGQ9Y6K9 419 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN12O95859 305 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 INHBAP08476 426 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 STMN1P16949 149 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 BDKRB1P46663 353 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEMA6CQ9H3T2 930 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 HRASLS2Q9NWW9 162 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM9Q9P0T7 183 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDP2Q9P2J9 529 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C74A6NCV1 312 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFYI3L273 518 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBBP07437 444 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPBGLP0DKB5 382 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRB7Q14451 532 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF460Q14592 562 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM207Q6UWW9 146 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 XKR8Q9H6D3 395 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF33A8MVX0 844 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9P02748 559 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 THRAP10827 490 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB28P51157 221 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMBQ6PCB8 327 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASGRP3Q8IV61 690 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC12Q96GR4 267 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MENTQ9BUN1 341 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C2Q9NZP2 312 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB21Q9UL25 225 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAGL1Q9UM63 463 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MATN2O00339 956 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPINK2P20155 84 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSH2P43246 934 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHC2P98077 582 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKAA1Q13131 559 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF19Q5T6S3 580 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMC6Q6NXE6 501 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH9Q86YJ5 346 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRTNQ99748 197 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRADBQ9C0K7 418 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF180Q9UJW8 692 aa32.12■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB14O43829 449 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPSTP25325 297 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINB9P50453 376 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFERP55789 205 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB10P61026 200 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MROH9Q5TGP6 573 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRGCQ6NXR0 463 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB42Q8N4Z0 105 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC74BQ96LY2 380 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGM7Q96PF1 710 aa32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASGRF2O14827 1237 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8GP07360 202 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKLRP30613 574 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SP140Q13342 867 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCSMST1Q4G0I0 132 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAOK1Q7L7X3 1001 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FETUBQ9UGM5 382 aa32.1■■■□□ 2.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 CIDEBQ9UHD4 219 aa32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms