RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 MRGPREQ86SM8 312 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 GALNT16Q8N428 558 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 TM9SF4Q92544 642 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 PTERQ96BW5 349 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM60AQ9NP50 221 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 TFR2Q9UP52 801 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 ICKQ9UPZ9 632 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 TEX15Q9BXT5 2789 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4-208ENST00000572010 H7C0S8 307 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 QSOX1O00391 747 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 KDM1AO60341 852 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 UGT2B7P16662 529 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TPH1P17752 444 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 MYBPC3Q14896 1274 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 NR6A1Q15406 480 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 OR2A14Q96R47 310 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ESPL1Q14674 2120 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PJA2O43164 708 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 FTH1P02794 183 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 RNF224P0DH78 156 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 NSG1P42857 185 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 RWDD2BP57060 319 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 BRD3Q15059 726 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PARP6Q2NL67 630 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TRIM73Q86UV7 250 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ZADH2Q8N4Q0 377 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 STYXQ8WUJ0 223 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ELMO1Q92556 727 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 NDC1Q9BTX1 674 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ISM1B1AKI9 464 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CBX6O95503 412 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PRSS56P0CW18 603 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPN7P35236 360 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 DBN1Q16643 649 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CYP2A13Q16696 494 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 RNF214Q8ND24 703 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 GBP5Q96PP8 586 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TSPY26PQ9H489 355 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A0J9YY10 115 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 GLRBP48167 497 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 POU6F1Q14863 301 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ZIC1Q15915 447 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SYTL3Q4VX76 610 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 C5orf34Q96MH7 638 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CDYLQ9Y232 598 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SPTBP11277 2137 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC78A2IDD5 438 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms