RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CD151	P48509	253 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PITPNB	P48739	271 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPA	P49450	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR143	P51810	404 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC37A1	P57057	533 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SHC2	P98077	582 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CUL2	Q13617	745 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KEAP1	Q14145	624 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VEPH1	Q14D04	833 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R7	Q15435	360 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TAZ	Q16635	292 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UGP2	Q16851	508 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO43	Q4G163	708 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MTSS1L	Q765P7	747 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DET1	Q7L5Y6	550 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPAT4	Q86UL3	456 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VASH2	Q86V25	355 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AMZ2	Q86W34	360 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS52	Q8N1B4	723 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK11	Q8NG66	645 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NCOA7	Q8NI08	942 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPT2	Q8TD30	523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD54L	Q92698	747 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HARBI1	Q96MB7	349 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	S1PR5	Q9H228	398 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NGB	Q9NPG2	151 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	THSD1	Q9NS62	852 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAPD2	Q15021	1401 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WZY1	265 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GVY2	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND3	A2RUS2	1198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM149A	A5PLN7	773 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ERICH4	A6NGS2	130 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YIN7	160 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F3	O00716	465 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN4	O14493	209 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SELENOF	O60613	162 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CYTIP	O60759	359 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF11	O60813	436 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOBTB1	O94844	696 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6B1	O95007	311 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL10	P02778	98 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PEPD	P12955	493 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM2	P21980	687 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN4	P29074	926 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TYK2	P29597	1187 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GDI1	P31150	447 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RYK	P34925	604 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT5A	P41221	380 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRCP	P42785	496 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGER3	P43115	390 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AGTR2	P50052	363 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ASCL1	P50553	236 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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