RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	C2orf74	A8MZ97	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MAP3K7	O43318	606 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	RNF8	O76064	485 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	USP1	O94782	785 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TOX	O94900	526 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	PRAMEF1	O95521	474 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	RARA	P10276	462 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	DES	P17661	470 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ALAS2	P22557	587 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	CCNC	P24863	283 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MSX1	P28360	303 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MEOX1	P50221	254 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	HSPH1	Q92598	858 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TSGA13	Q96PP4	275 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	OR2A14	Q96R47	310 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	AGPAT1	Q99943	283 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	PMPCB	O75439	489 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	CTAG2	O75638	210 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	POLB	P06746	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	HEXA	P06865	529 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	C8B	P07358	591 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	COX6A1	P12074	109 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	UGT2B7	P16662	529 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	PCK1	P35558	622 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	OLIG2	Q13516	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	DET1	Q7L5Y6	550 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	SIAH3	Q8IW03	269 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ASB1	Q9Y576	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298		A0A1B0GX78	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298		A0A1W2PQ72	361 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	BMP10	O95393	424 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	SERPINA7	P05543	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	CD48	P09326	243 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	INHBB	P09529	407 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ACPP	P15309	386 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	HSF1	Q00613	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	GSE1	Q14687	1217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CS-208	ENST00000547298	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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