RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ST6GAL1P15907 406 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 GRIA1P42261 906 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 LRRC6Q86X45 466 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ABHD17AQ96GS6 310 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ISM1B1AKI9 464 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 OR1I1O60431 355 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CD63P08962 238 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PAMP19021 973 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ACADLP28330 430 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PMS2P54278 862 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 KIR2DS3Q14952 304 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 UGT8Q16880 541 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TEX19Q8NA77 164 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PPM1MQ96MI6 270 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 FOPNLQ96NB1 174 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ICKQ9UPZ9 632 aa16.37■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 A0A0J9YY10 115 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 UGT2B7P16662 529 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 GPS2Q13227 327 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ARMC3Q5W041 872 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 DSELQ8IZU8 1212 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 OR1L3Q8NH93 324 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 NLNQ9BYT8 704 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TRIM4Q9C037 500 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CHST8Q9H2A9 424 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ACSS2Q9NR19 701 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 H3BMM5 538 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 OR2B3O76000 313 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PVRP15151 417 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TPSB2P20231 275 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CASRP41180 1078 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 RAB28P51157 221 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 KLRB1Q12918 225 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ABRQ12979 859 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TPSAB1Q15661 275 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CASC4Q6P4E1 433 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ZNF534Q76KX8 674 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PBKQ96KB5 322 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ZNF778Q96MU6 729 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 MYO18BQ8IUG5 2567 aa16.35■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 ZNF749O43361 778 aa16.34■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CCR7P32248 378 aa16.34■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 CXCR5P32302 372 aa16.34■□□□□ 0.21
CASP9-211ENST00000546969 KCNJ1P48048 391 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms