RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 FBXL22Q6P050 247 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 AKAP14Q86UN6 197 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 ITFG1Q8TB96 612 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 ELMO1Q92556 727 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 NTAN1Q96AB6 310 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 PYCR2Q96C36 320 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 EXOC2Q96KP1 924 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 C8orf48Q96LL4 319 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 FCRL5Q96RD9 977 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 C8orf4Q9NR00 106 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 MRGBPQ9NV56 204 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 AIG1Q9NVV5 245 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.96□□□□□ -0.97
THBS3-211ENST00000541990 E9PAM4 449 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 MTSS1O43312 755 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 MAFKO60675 156 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DLGAP3O95886 979 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 PSMB9P28065 219 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 SERPINB1P30740 379 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 ACVRL1P37023 503 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 POLD2P49005 469 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CLCN5P51795 746 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 FOXM1Q08050 763 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 SCAPQ12770 1279 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 ARTNQ5T4W7 220 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 STEAP3Q658P3 488 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 GAREM2Q75VX8 874 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 TP53INP1Q96A56 240 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CDK15Q96Q40 435 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 VAT1Q99536 393 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 TRMOQ9BU70 441 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CEP44Q9C0F1 390 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DSN1Q9H410 356 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.96□□□□□ -0.98
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THBS3-211ENST00000541990 IFT52Q9Y366 437 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.96□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 H7C4K7 107 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 AP3B1O00203 1094 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 S1PR4O95977 384 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 FTH1P02794 183 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 UMPSP11172 480 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 GABRR2P28476 465 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 HTR1EP28566 365 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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THBS3-211ENST00000541990 COPZ1P61923 177 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 EMX2Q04743 252 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 SLC14A2Q15849 920 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 SMUG1Q53HV7 270 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DESI1Q6ICB0 168 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 RANBP10Q6VN20 620 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 BEND5Q7L4P6 421 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 VNN3Q9NY84 501 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 IL37Q9NZH6 218 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CCL26Q9Y258 94 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 LINC01553A4QN01 128 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 SNPHO15079 494 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 NUAK1O60285 661 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 DFNA5O60443 496 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 SLC22A3O75751 556 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CHEK2O96017 543 aa8.95□□□□□ -0.98
THBS3-211ENST00000541990 CST1P01037 141 aa8.95□□□□□ -0.98
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