RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SHMT2P34897 504 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CBSP35520 551 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ATP1A4Q13733 1029 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ITIH4Q14624 930 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZIC1Q15915 447 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MED25Q71SY5 747 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 LINC00523Q86TU6 105 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TCTN2Q96GX1 697 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR2A14Q96R47 310 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 NUDT9Q9BW91 350 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MFRPQ9BY79 579 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 LUZP4Q9P127 313 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PCSK5Q92824 1860 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 LRRK2Q5S007 2527 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 A0A0U1RQJ8 604 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 DPM1O60762 260 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR2B3O76000 313 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 FTH1P02794 183 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OTX2P32243 289 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GABRA4P48169 554 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 RRADP55042 308 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 C1orf189Q5VU69 101 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MLIPQ5VWP3 458 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PACS1Q6VY07 963 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 RAB43Q86YS6 212 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 IMPACTQ9P2X3 320 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 POLG2Q9UHN1 485 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.34■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.33■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 H3BMH7 237 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 OR1I1O60431 355 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CTSBP07858 339 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 OR56A5P0C7T3 313 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 KIF5AQ12840 1032 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RAPSNQ13702 412 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SYTL3Q4VX76 610 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FHL5Q5TD97 284 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 HDAC10Q969S8 669 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SGSM3Q96HU1 749 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GPR83Q9NYM4 423 aa16.33■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 A0A0J9YY10 115 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ISM1B1AKI9 464 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 AGFG2O95081 481 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CDH17Q12864 832 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MRGPREQ86SM8 312 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 Q8NA96 180 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GBP5Q96PP8 586 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 DESI2Q9BSY9 194 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RBSNQ9H1K0 784 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 HEATR9A2RTY3 570 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GAS8O95995 478 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.4 ms