RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 C11orf88Q6PI97 169 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PTPN18Q99952 460 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 NANOGQ9H9S0 305 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 MAP10Q9P2G4 905 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PTGESO14684 152 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PRAMEF11O60813 436 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 SNAP29O95721 258 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 NUDT14O95848 222 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 S1PR4O95977 384 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ALOX5P09917 674 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 FUT4P22083 530 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 DNAJB1P25685 340 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 GKP32189 559 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 HSPB3Q12988 150 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PTGR1Q14914 329 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TRNP1Q6NT89 227 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 STON2Q8WXE9 905 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 IGSF8Q969P0 613 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 OMA1Q96E52 524 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 A0A0G2JN53 185 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 G3V2L1 256 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ARVCFO00192 962 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CASKO14936 926 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CCNKO75909 580 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 C8GP07360 202 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CD36P16671 472 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ENGP17813 658 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 NUDT6P53370 316 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 MAPK12P53778 367 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TAS2R41P59536 307 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 QPRTQ15274 297 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZBTB6Q15916 424 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 KDM1BQ8NB78 822 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PDPRQ8NCN5 879 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 C8orf48Q96LL4 319 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 MUS81Q96NY9 551 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 FNIP2Q9P278 1114 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 DEC1Q9P2X7 70 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 PHLPP1O60346 1717 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 C4AP0C0L4 1744 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 C4BP0C0L5 1744 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 MYO10Q9HD67 2058 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 SCAMP1O15126 338 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 AP2A2O94973 939 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 SNX4O95219 450 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 EPOP01588 193 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 FGBP02675 491 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CYP11A1P05108 521 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 TCF3P15923 654 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ACADVLP49748 655 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CDKN2DP55273 166 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 UPP1Q16831 310 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 HKDC1Q2TB90 917 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 MYLK3Q32MK0 819 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 GPR33Q49SQ1 333 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 IFI44LQ53G44 452 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 DCST1Q5T197 706 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 AKAP14Q86UN6 197 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.89□□□□□ -1.15
NEK1-208ENST00000512193 ZNF366Q8N895 744 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms