RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM73	Q86UV7	250 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCU	Q8NE86	351 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1L3	Q8NH93	324 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT55	Q8WUE5	264 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	STARD8	Q92502	1023 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPGAT1	Q92604	370 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINB12	Q96P63	405 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2A14	Q96R47	310 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC1	Q99614	292 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM60A	Q9NP50	221 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	LHX9	Q9NQ69	397 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf74	A8MZ97	194 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSB	P07858	339 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKAR1A	P10644	381 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLN	P12872	115 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	UGT2B7	P16662	529 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKLR	P30613	574 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHMT2	P34897	504 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLST	P36957	453 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNTA	P49354	379 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPS2	Q13227	327 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KYNU	Q16719	465 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYTL3	Q4VX76	610 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARMC3	Q5W041	872 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCN10	Q6JVE6	187 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPU	Q71F23	418 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM135	Q86UB9	458 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCND1	Q9NSA2	647 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	STARD5	Q9NSY2	213 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALP	Q9UBC7	116 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLG2	Q9UHN1	485 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PADI1	Q9ULC6	663 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF5C	O60282	957 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	NIPSNAP2	O75323	286 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFS3	O75489	264 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCRG1	O75711	98 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G2A	P14555	144 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	IVD	P26440	423 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	RORA	P35398	523 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTGIR	P43119	386 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL4D	P49703	201 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNASE1L3	Q13609	305 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	BORA	Q6PGQ7	559 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8K5	Q8NH50	307 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL17F	Q96PD4	163 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED16	Q9Y2X0	877 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFS1	Q9Y697	457 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TENM4	Q6N022	2769 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8W8V4	182 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf105	O95561	183 aa		12.27	□□□□□ -0.45

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