RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	SLC28A2	O43868	658 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TLR5	O60602	858 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DIRAS1	O95057	198 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ITGB1	P05556	798 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MAP2K4	P45985	399 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ACOX1	Q15067	660 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574		C9IYK1	514 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574		G3V2L1	256 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PGGT1B	P53609	377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	PFKP	Q01813	784 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CACNG1	Q06432	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TGM3	Q08188	693 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ABR	Q12979	859 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ADAM2	Q99965	735 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PKD1-222	ENST00000496574	CLIC1	O00299	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	CXCR3	P49682	368 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	GNA13	Q14344	377 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	GRM2	Q14416	872 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	GRB7	Q14451	532 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	LGI4	Q8N135	537 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	ATE1	O95260	518 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	MT-ND2	P03891	347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	RABGGTB	P53611	331 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	DCDC1	P59894	354 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	SGK2	Q9HBY8	427 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	NME4	O00746	187 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	C1R	P00736	705 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	PAX3	P23760	479 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	PLA2G16	P53816	162 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	COL1A2	P08123	1366 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	CDC7	O00311	574 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	AP3D1	O14617	1153 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	GRIA2	P42262	883 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	VGLL4	Q14135	290 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	USP7	Q93009	1102 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	FFAR2	O15552	330 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	IFNA7	P01567	189 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PKD1-222	ENST00000496574	NOV	P48745	357 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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