RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491870.1

DEFB109F-201, Transcript of defensin beta 109F (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene DEFB109F, Length 277 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB109F-201ENST00000491870 C1RP00736 705 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 F9P00740 461 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 GSNP06396 782 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ANXA6P08133 673 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PRKCAP17252 672 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ERCC2P18074 760 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 FDXRP22570 491 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PAX3P23760 479 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PIGAP37287 484 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 AVPR1AP37288 418 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 MAGEA11P43364 429 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 NRIP1P48552 1158 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TRPC1P48995 793 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 SULT1E1P49888 294 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 SLC26A2P50443 739 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 STAT5BP51692 787 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 MAPK10P53779 464 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 OR4D2P58180 307 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 HERVK_113P63132 956 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TUBA1BP68363 451 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ADAM17P78536 824 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ZNF45Q02386 682 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TEKQ02763 1124 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 KCNAB2Q13303 367 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 DNASE1L3Q13609 305 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 NFYCQ13952 458 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 KEAP1Q14145 624 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ZNF460Q14592 562 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 KCTD2Q14681 263 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ZBTB6Q15916 424 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 DUSP7Q16829 419 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PGS1Q32NB8 556 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 SMUG1Q53HV7 270 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 METTL7BQ6UX53 244 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RNF165Q6ZSG1 346 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TUBA1AQ71U36 451 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 DET1Q7L5Y6 550 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ZFAND4Q86XD8 727 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 DEFB106AQ8N104 65 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 NPWQ8N729 165 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RNF149Q8NC42 400 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 NDNFQ8TB73 568 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 FCGR1BQ92637 280 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 FATE1Q969F0 183 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 VPS33AQ96AX1 596 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RNF170Q96K19 258 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TEPSINQ96N21 525 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 LRRC3Q9BY71 257 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CLPBQ9H078 707 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ING2Q9H160 280 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 MMP27Q9H306 513 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 ACAD9Q9H845 621 aa4.59□□□□□ -1.67
DEFB109F-201ENST00000491870 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms