RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 CBLBQ13191 982 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 CUL1Q13616 776 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM73Q86UV7 250 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 OOSP2Q86WS3 158 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PDIK1LQ8N165 341 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 WHRNQ9P202 907 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 POMT2Q9UKY4 750 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PSAT1Q9Y617 370 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 SPTBP11277 2137 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 HCRTR1O43613 425 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 C1orf105O95561 183 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 C1QAP02745 245 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 APOA4P06727 396 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 EBLN1P0CF75 366 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ST6GAL1P15907 406 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 CHRM3P20309 590 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ARL4CP56559 192 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 VASH2Q86V25 355 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ZBTB2Q8N680 514 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PANX3Q96QZ0 392 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 OR2A14Q96R47 310 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 OR6C1Q96RD1 312 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 GPR21Q99679 349 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRVP-202ENST00000490575 GSAPA4D1B5 854 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TLCD2A6NGC4 264 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 CTSBP07858 339 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PKLRP30613 574 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 CDKN2DP55273 166 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 FOXM1Q08050 763 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 GPR19Q15760 415 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 ZIC1Q15915 447 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 KYNUQ16719 465 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 FBXO25Q8TCJ0 367 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 CD200R1Q8TD46 325 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 DDA1Q9BW61 102 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM60AQ9NP50 221 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 MGAQ8IWI9 3026 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SMAPO00193 183 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 MATN4O95460 622 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC4O95801 387 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 UGT2B7P16662 529 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SSTR1P30872 391 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PLTPP55058 493 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 GPX6P59796 221 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 KLHL35Q6PF15 583 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 D2HGDHQ8N465 521 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 DLG3Q92796 817 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 NKD1Q969G9 470 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC39Q96DD0 335 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PRORYQ9H606 182 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms