RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF358	Q9NW07	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A1W2PQF6	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WWP2	O00308	870 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WNT9A	O14904	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PGRMC2	O15173	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RFPL1	O75677	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PROC	P04070	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	QDPR	P09417	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CPT2	P23786	658 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IL32	P24001	234 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	VIPR1	P32241	457 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ECI1	P42126	302 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNJ5	P48544	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GEM	P55040	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SCAP	Q12770	1279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NCSTN	Q92542	709 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261		H7C0C1	242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DUX1	O43812	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LEFTY1	O75610	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL18	O94889	574 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LRIG2	O94898	1065 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LCA5L	O95447	670 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RPN2	P04844	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CHN1	P15882	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IDS	P22304	550 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GSTT1	P30711	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IRAK1	P51617	712 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GSDMD	P57764	484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SEMG2	Q02383	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	STX5	Q13190	355 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR176	Q14439	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PIM3	Q86V86	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MYO19	Q96H55	970 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ART5	Q96L15	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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