RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	FAM60A	Q9NP50	221 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	TFR2	Q9UP52	801 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	KCNN4	O15554	427 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	HCRTR1	O43613	425 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	LDB2	O43679	373 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	HBQ1	P09105	142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	PRSS56	P0CW18	603 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CBSL	P0DN79	551 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	MC4R	P32245	332 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CBS	P35520	551 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	HADHA	P40939	763 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SPARCL1	Q14515	664 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	PRPSAP1	Q14558	356 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	GPR33	Q49SQ1	333 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	C1orf189	Q5VU69	101 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	MLIP	Q5VWP3	458 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	GPR135	Q8IZ08	494 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	IQCK	Q8N0W5	287 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ACTL9	Q8TC94	416 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	RANBP9	Q96S59	729 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	C5AR2	Q9P296	337 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ICK	Q9UPZ9	632 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SEC16A	O15027	2179 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054		H3BMH7	237 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	OR2B3	O76000	313 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CTSB	P07858	339 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	UGT2B7	P16662	529 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ACRV1	P26436	265 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	MAGEA1	P43355	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	GABRA4	P48169	554 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	FOXL2	P58012	376 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	RPA4	Q13156	261 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	MYBPC3	Q14896	1274 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ZIC1	Q15915	447 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	DCAF10	Q5QP82	559 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	HOOK3	Q86VS8	718 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CNGA4	Q8IV77	575 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	POM121	Q96HA1	1249 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SPATA13	Q96N96	652 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	IP6K3	Q96PC2	410 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	GBP5	Q96PP8	586 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	MASP2	O00187	686 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	PEX12	O00623	359 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	PJA2	O43164	708 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	ALPP	P05187	535 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	RBP3	P10745	1247 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SHMT2	P34897	504 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	FOLR3	P41439	243 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	COPS2	P61201	443 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SSPN	Q14714	243 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SLC9A5	Q14940	896 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTSL-205	ENST00000482054	GALNT16	Q8N428	558 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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