RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472464.6

CCZ1B-208, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 3

Gene CCZ1B, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-208	ENST00000472464		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	FLRT2	O43155	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	KLKB1	P03952	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	RARG	P13631	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	KRT10	P13645	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CASP1	P29466	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ACSL1	P33121	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	POLD2	P49005	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TUB	P50607	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	MFAP3	P55082	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SEMG2	Q02383	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ALCAM	Q13740	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CBFB	Q13951	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ZNF234	Q14588	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	STARD3	Q14849	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PSMD6	Q15008	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TBATA	Q96M53	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GPR78	Q96P69	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TBCB	Q99426	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	NPC1	O15118	1278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TNFSF14	O43557	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ACADM	P11310	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GRK6	P43250	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	NDST1	P52848	882 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PGGT1B	P53609	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	EME1	Q96AY2	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCZ1B-208	ENST00000472464	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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