RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 PPM1NQ8N819 430 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 BIRC8Q96P09 236 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 FMO2Q99518 471 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 NDNQ99608 321 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 GPR21Q99679 349 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ZPBPQ9BS86 351 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 RAB33BQ9H082 229 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 DHRS7Q9Y394 339 aa9.3□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TLCD2A6NGC4 264 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 B4E171 279 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 E7ESA3 106 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ITIH1P19827 911 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CYP2A7P20853 494 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ACADLP28330 430 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ATP5DP30049 168 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SLC5A2P31639 672 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 HSD17B2P37059 387 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TSPAN7P41732 249 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ATP1A2P50993 1020 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 RAB28P51157 221 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TUBB4BP68371 445 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ACY1Q03154 408 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SLMAPQ14BN4 828 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TEX35Q5T0J7 233 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 STEAP4Q687X5 459 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 RAPH1Q70E73 1250 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 KMT5CQ86Y97 462 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 VRK3Q8IV63 474 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 OR6C1Q96RD1 312 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 BTN3A1O00481 513 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 KLK10O43240 276 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 C9P02748 559 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 MPC1LP0DKB6 136 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CCL4P13236 92 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CD9P21926 228 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CD82P27701 267 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 ABCG1P45844 678 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CLCN7P51798 805 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 MC2RQ01718 297 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 CFHR1Q03591 330 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 IL11RAQ14626 422 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-208ENST00000462335 KIR2DS3Q14952 304 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms