RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 G3V2L1 256 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TK2O00142 265 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 BTN3A1O00481 513 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 COPEO14579 308 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TM9SF1O15321 606 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZW10O43264 779 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf105O95561 183 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TFEBP19484 476 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNA4P22459 653 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 HALP42357 657 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CCT5P48643 541 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 AP1S2P56377 157 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 NR1D2Q14995 579 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ARL10Q8N8L6 244 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 PDPRQ8NCN5 879 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 GPR156Q8NFN8 814 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 RDH11Q8TC12 318 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB9Q96C00 473 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CENPHQ9H3R5 247 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ALG9Q9H6U8 611 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 UCK1Q9HA47 277 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 PARVBQ9HBI1 364 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 POT1Q9NUX5 634 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 PDE10AQ9Y233 779 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 OARD1Q9Y530 152 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 U3KQA8 63 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM38O00635 465 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SH3BP5O60239 455 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SNX2O60749 519 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SPAG7O75391 227 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZWINTO95229 277 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CATP04040 527 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 RBP1P09455 135 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CD59P13987 128 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFS1P28331 727 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 GGT5P36269 586 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC19A1P41440 591 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 GLRBP48167 497 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 NR0B2Q15466 257 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TGFBIQ15582 683 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC153Q494R4 210 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 KLC3Q6P597 504 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB124Q8NES8 71 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 NAT6Q93015 286 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 PIEZO1Q92508 2521 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP250Q9BV73 2442 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-207ENST00000454947 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms