RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC23LQ6PF05 361 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 POMT2Q9UKY4 750 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ICKQ9UPZ9 632 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RAXQ9Y2V3 346 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf74A8MZ97 194 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf172C9J069 976 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS26AO75436 327 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf105O95561 183 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CBSLP0DN79 551 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CBSP35520 551 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNFP41002 786 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPK10P53779 464 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1CAP62136 330 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GUCY2DQ02846 1103 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM129CQ86XR2 697 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K3Q99759 626 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZPBPQ9BS86 351 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 AGRPO00253 132 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 BTN3A1O00481 513 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MPC1LP0DKB6 136 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEA4P43358 317 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB28P51157 221 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GRB7Q14451 532 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 IL11RAQ14626 422 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM136AQ96C01 138 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR21Q99679 349 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC30A3Q99726 388 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MENTQ9BUN1 341 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DPH1Q9BZG8 443 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 XKR8Q9H6D3 395 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFATQ9P243 1243 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 VWA7Q9Y334 891 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ESYT3A0FGR9 886 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PIPSLA2A3N6 862 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GSAPA4D1B5 854 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF10O60809 474 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SSTR1P30872 391 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SEPHS1P49903 392 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 HSD11B2P80365 405 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 D2HGDHQ8N465 521 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CD200R1Q8TD46 325 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKL2Q92772 493 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NFS1Q9Y697 457 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FRYQ5TBA9 3013 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 APC2O95996 2303 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 IGF2RP11717 2491 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms