RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LCORLQ8N3X6 602 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NSMAFQ92636 917 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ACDQ96AP0 544 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NGLY1Q96IV0 654 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF577Q9BSK1 485 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UCK1Q9HA47 277 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NCDNQ9UBB6 729 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR7A17O14581 309 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN3O15551 220 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 MAPK8P45983 427 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HTR3AP46098 478 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPR17Q13304 367 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF234Q14588 700 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NECTIN1Q15223 517 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CBWD6Q4V339 395 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CBWD3Q5JTY5 395 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FIBCD1Q8N539 461 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OXER1Q8TDS5 423 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ9Q92806 393 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PTP4A1Q93096 173 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT15Q9NV35 164 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NOD1Q9Y239 953 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WZY1 265 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 K7ERU9 68 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 OR1G1P47890 313 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GCLMP48507 274 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TAP2Q03519 686 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BST1Q10588 318 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPR158Q5T848 1215 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PET117Q6UWS5 81 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 STK35Q8TDR2 534 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 CIPCQ9C0C6 399 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR51B6Q9H340 312 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNGP07510 517 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DTYMKP23919 212 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DCKP27707 260 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FOXN2P32314 431 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RORCP51449 518 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GALCP54803 685 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RAC1P63000 192 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DYNLT1P63172 113 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MPP1Q00013 466 aa5.5□□□□□ -1.53
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