RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 TYMPP19971 482 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 IGFBP5P24593 272 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 AKT1P31749 480 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PHC1P78364 1004 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLC13A2Q13183 592 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PLD3Q8IV08 490 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MICU2Q8IYU8 434 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NCLNQ969V3 563 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS12Q96DT0 336 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 UROC1Q96N76 676 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HBEGFQ99075 208 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB18Q99592 522 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 INVSQ9Y283 1065 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 U3KQV3 271 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MT-ND2P03891 347 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PBX3P40426 434 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 IL10RBQ08334 325 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KEAP1Q14145 624 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MCFD2Q8NI22 146 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ITCHQ96J02 903 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 VPS26AO75436 327 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CREG1O75629 220 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 IL1RNP18510 177 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 VAC14Q08AM6 782 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FADDQ13158 208 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRNQ16849 979 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MON1AQ86VX9 555 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CHPFQ8IZ52 775 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HTRA1Q92743 480 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 A8MU76 341 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RGS10O43665 173 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 DET1Q7L5Y6 550 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HTTP42858 3142 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CLDN24A6NM45 220 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 H0Y626 953 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SNPHO15079 494 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM16O95361 564 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FPGSQ05932 587 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf183Q5T699 404 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LINGO1Q96FE5 620 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A13Q96H72 371 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PKP3Q9Y446 797 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TAF4O00268 1085 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms