RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 KDM1AO60341 852 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 PVRP15151 417 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 UGT2B7P16662 529 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 PTGIRP43119 386 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 HOOK3Q86VS8 718 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 HPS6Q86YV9 775 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 GPR135Q8IZ08 494 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 OR2A14Q96R47 310 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 DESI2Q9BSY9 194 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 MAST4O15021 2626 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF749O43361 778 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM63AO94886 807 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 AGXTP21549 392 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 CDC25BP30305 580 aa20.28■□□□□ 0.84
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LIMS1-208ENST00000428064 SYTL3Q4VX76 610 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC38Q502W7 563 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 MED25Q71SY5 747 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YY10 115 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 C9J4A7 227 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 TPBGLP0DKB5 382 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 ADRA1DP25100 572 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 MLLT10P55197 1068 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 CHAF1BQ13112 559 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC10Q969S8 669 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 FAM60AQ9NP50 221 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 CASS4Q9NQ75 786 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-208ENST00000428064 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC78A2IDD5 438 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CD63P08962 238 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CCL11P51671 97 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 RRADP55042 308 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS3Q14952 304 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.26■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB2Q8N680 514 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 OR4L1Q8NH43 312 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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LIMS1-208ENST00000428064 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 E7EVH7 732 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 OR1I1O60431 355 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 OR2B3O76000 313 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SPTBP11277 2137 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 BRD3Q15059 726 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ZIC1Q15915 447 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM73Q86UV7 250 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 IP6K3Q96PC2 410 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CARD6Q9BX69 1037 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PAK5Q9P286 719 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 CDYLQ9Y232 598 aa20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PCSK5Q92824 1860 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 LRRK2Q5S007 2527 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GPC4O75487 556 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 IFNB1P01574 187 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 RPN2P04844 631 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 PKLRP30613 574 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 GRIA1P42261 906 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 RAB28P51157 221 aa20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LIMS1-208ENST00000428064 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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