RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422847.1

LINC00857-201, long intergenic non-protein coding RNA 857, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00857, Length 2,161 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00857-201ENST00000422847 IL31Q6EBC2 164 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 TUBA1AQ71U36 451 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 SYVN1Q86TM6 617 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 OR2T12Q8NG77 320 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 OR2T11Q8NH01 316 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 ATL1Q8WXF7 558 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 EDEM1Q92611 657 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 HTRA1Q92743 480 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 TOX2Q96NM4 488 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 DERL2Q9GZP9 239 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 NEK6Q9HC98 313 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 SCN3BQ9NY72 215 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 TIMM22Q9Y584 194 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00857-201ENST00000422847 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 H0Y626 953 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 MAN1A2O60476 641 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 TRIM16O95361 564 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PSMB9P28065 219 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ARPC4P59998 168 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 KEAP1Q14145 624 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 MBTPS1Q14703 1052 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 STEAP3Q658P3 488 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ARL10Q8N8L6 244 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 POC5Q8NA72 575 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 FBXO30Q8TB52 745 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 FIG4Q92562 907 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PEX13Q92968 403 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 TP53INP1Q96A56 240 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 LGALS12Q96DT0 336 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 RNF112Q9ULX5 631 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 AGAP5A6NIR3 686 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 METTL15A6NJ78 407 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 A6NJY4 79 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 KLK8O60259 260 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 IL1RNP18510 177 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 TGFBR2P37173 567 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 RAPSNQ13702 412 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ZNF404Q494X3 552 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PNCKQ6P2M8 343 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 FATE1Q969F0 183 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 NACA2Q9H009 215 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 EXD2Q9NVH0 621 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 FNIP2Q9P278 1114 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 OPTCQ9UBM4 332 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 PCTPQ9UKL6 214 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 TBX21Q9UL17 535 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 OR51F1A6NGY5 319 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 HHLA1C9JL84 531 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 RGS10O43665 173 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 ECI2O75521 394 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 IGLV3-25P01717 112 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 MT-ND2P03891 347 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00857-201ENST00000422847 RETP07949 1114 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms