RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.65□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 MARCH11A6NNE9 402 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 E5RI56 91 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC30A4O14863 429 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SIGLEC6O43699 453 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 XYLBO75191 536 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 S100A8P05109 93 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ERVK-10P10266 1014 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 FGFR1P11362 822 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 KRT15P19012 456 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ITGB8P26012 769 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 EPHA3P29320 983 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 GSK3AP49840 483 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DEFA1P59665 94 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DEFA3P59666 94 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 IKZF1Q13422 519 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TEAD4Q15561 434 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TAB1Q15750 504 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC1A5Q15758 541 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TIGD6Q17RP2 521 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 GPR33Q49SQ1 333 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 RETREG3Q86VR2 466 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 BIRC7Q96CA5 298 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TMCO6Q96DC7 493 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 CSF3RQ99062 836 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 GPR20Q99678 358 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PTPN18Q99952 460 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SCN4AP35499 1836 aa6.65□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM210A6NLX4 147 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 INPPL1O15357 1258 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SEC14L2O76054 403 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 CD46P15529 392 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 36.2
LRRTM4-205ENST00000409911 MAPK4P31152 587 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 CHRNA3P32297 505 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 GRK3P35626 688 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ARL2P36404 184 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PTGIRP43119 386 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 NRLP54845 237 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SEMA3BQ13214 749 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 CAPSQ13938 189 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 NFYCQ13952 458 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DGUOKQ16854 277 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 KIF19Q2TAC6 998 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 GPAT3Q53EU6 434 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 BROXQ5VW32 411 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 ATCAYQ86WG3 371 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PRELID2Q8N945 189 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 C12orf29Q8N999 325 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 NR4A3Q92570 626 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PTERQ96BW5 349 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM122AQ96E09 287 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 C7orf34Q96L11 122 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 C10orf90Q96M02 699 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 RTKNQ9BST9 563 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 DUSP26Q9BV47 211 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TRABDQ9H4I3 376 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 KLHL1Q9NR64 748 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 GDE1Q9NZC3 331 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.64□□□□□ -1.35
LRRTM4-205ENST00000409911 PLXNB2O15031 1838 aa6.64□□□□□ -1.35
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