RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 PRR19A6NJB7 356 aa19.63■□□□□ 0.73
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ODC1-202ENST00000405333 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 AK4P27144 223 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 IDH3AP50213 366 aa19.63■□□□□ 0.73
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ODC1-202ENST00000405333 ARMCX6Q7L4S7 300 aa19.61■□□□□ 0.73
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ODC1-202ENST00000405333 KATNA1O75449 491 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 OR4F21O95013 312 aa19.6■□□□□ 0.73
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ODC1-202ENST00000405333 CD27P26842 260 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 EPHA3P29320 983 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 FNTBP49356 437 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 FZD2Q14332 565 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 GRB7Q14451 532 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 UGT3A2Q3SY77 523 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 CDKL4Q5MAI5 379 aa19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ODC1-202ENST00000405333 CADM4Q8NFZ8 388 aa19.6■□□□□ 0.73
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