RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 PIGXQ8TBF5 258 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PPW3 197 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35F4A4IF30 521 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR6C75A6NL08 312 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ORC5O43913 435 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SEC14L1Q92503 715 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KLRG1Q96E93 195 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PBX3P40426 434 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MAN2A2P49641 1150 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RABL3Q5HYI8 236 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 HOXC6P09630 235 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 AVPR1BP47901 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 VBP1P61758 197 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ERVK-8P63133 956 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ULK3Q6PHR2 472 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IQCHQ86VS3 1027 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TMCO6Q96DC7 493 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DUSP26Q9BV47 211 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KDM4BO94953 1096 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FCER2P06734 321 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TIE1P35590 1138 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ACOX3O15254 700 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 AHSGP02765 367 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DNTTP04053 509 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ASLP04424 464 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 EPGNQ6UW88 154 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CHST9Q7L1S5 443 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LMLNQ96KR4 655 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 C8orf48Q96LL4 319 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GALPQ9UBC7 116 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GMEB1Q9Y692 573 aa14.97□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC7A4O43246 635 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MPZL2O60487 215 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PIGVQ9NUD9 493 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CKLFQ9UBR5 152 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TEX28O15482 410 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CXCL14O95715 111 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ELK4P28324 431 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IST1P53990 364 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCLAFQ15004 111 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 HID1Q8IV36 788 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF384Q8TF68 577 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IRGQQ8WZA9 623 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 H3BSH0 61 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PPEF2O14830 753 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MATN4O95460 622 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SCARB2Q14108 478 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KCT2Q8NC54 265 aa14.96□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A0X1KG70 313 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MTX2O75431 263 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 STATHP02808 62 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ALPIP09923 528 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ENGP17813 658 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AKT2P31751 481 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ALG11Q2TAA5 492 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MNTQ99583 582 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AQP12BA6NM10 295 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CSN2P05814 226 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GSK3BP49841 420 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ENTPD1P49961 510 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CDH4P55283 916 aa14.96□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PIGFQ07326 219 aa14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms