RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLCA4Q14CN2 919 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCSMST1Q4G0I0 132 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO39Q8N4B4 442 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPBAR1Q8TDU6 330 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNK13Q9HB14 408 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUDT4Q9NZJ9 180 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCT8L1PA6NM43 557 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf105O95561 183 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CATP04040 527 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTSEP14091 401 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAPK9P45984 424 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf61Q13536 156 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEAD4Q15561 434 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A9Q8IVM8 553 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHC3Q8NDX5 983 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCOLN3Q8TDD5 553 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 DRC3Q9H069 523 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 CIDEBQ9UHD4 219 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASF1AQ9Y294 204 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 FANCMQ8IYD8 2048 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK8O60259 260 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 EML2O95834 649 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 NME1P15531 152 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST1H2ADP20671 130 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARFIP2P53365 341 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 NFKB2Q00653 900 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 RCN2Q14257 317 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 UAP1L1Q3KQV9 507 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRRT3Q5FWE3 981 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM237Q96Q45 408 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST1H2AJQ99878 128 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 EGFL8Q99944 293 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 H2AFJQ9BTM1 129 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC61Q9BV99 259 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM54Q9BYV2 358 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL15Q9NXU5 204 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC5DQ6UXZ4 953 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNYL1Q8N7R7 359 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDPRQ8NCN5 879 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5AR1Q8NGP9 310 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 C12orf66Q96MD2 445 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSDMCQ9BYG8 508 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCF3Q9NUQ8 709 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC14BA6NHZ5 514 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 S100BP04271 92 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGTR2P50052 363 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 LPAL2Q16609 132 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYT12Q8IV01 421 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ESAMQ96AP7 390 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNPOQ9NVS9 261 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUSD2Q9UGT4 822 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52A4PA6NMU1 304 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0754O94854 1291 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF19Q2TAC6 998 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP157Q5JU67 520 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAF8Q7Z7C8 310 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCT6BQ92526 530 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 KNL1Q8NG31 2342 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPHS1O60500 1241 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHRNGP07510 517 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANXA5P08758 320 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 IMPDH1P20839 514 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCR10P46092 362 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 BNC1Q01954 994 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC121Q6ZUS5 278 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHBDF1Q96CC6 855 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAAR2Q9P1P5 351 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMCO1Q9UM00 188 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAPBPO15533 448 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP1S2P56377 157 aa26.98■■□□□ 1.91
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