RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 XPR1Q9UBH6 696 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 PLLPQ9Y342 182 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 OARD1Q9Y530 152 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-202ENST00000375429 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TARM1B6A8C7 271 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 SIGLEC6O43699 453 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 VIPP01282 170 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TPBGLP0DKB5 382 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MYF5P13349 255 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CYP2A7P20853 494 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 RPIAP49247 311 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MPP2Q14168 576 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 GPSM1Q86YR5 675 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 ARL10Q8N8L6 244 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 NRTNQ99748 197 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 POT1Q9NUX5 634 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 RNF112Q9ULX5 631 aa20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TK2O00142 265 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 PPM1DO15297 605 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 GDF9O60383 454 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 KERAO60938 352 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 PROCP04070 461 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 RPN2P04844 631 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 NDUFS1P28331 727 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 HHEXQ03014 270 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TGFBIQ15582 683 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TTC23LQ6PF05 361 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 APOLD1Q96LR9 279 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 PKP4Q99569 1192 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 RDH14Q9HBH5 336 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CCDC189A1A4V9 331 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 C4orf47A7E2U8 309 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 H3BQF6 201 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 PLIN3O60664 434 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 GUCA1CO95843 209 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CD59P13987 128 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MTHFD2P13995 350 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 HIST1H2ADP20671 130 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 FASLGP48023 281 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 SLC14A1Q13336 389 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 EXT2Q93063 718 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MED4Q9NPJ6 270 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 POLG2Q9UHN1 485 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 UBXN8O00124 270 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 MYO1CO00159 1063 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 CCDC153Q494R4 210 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 ARL15Q9NXU5 204 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 U3KQA8 63 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 TMEM120BA0PK00 339 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NELFE-202ENST00000375429 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms