RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SBF1O95248 1867 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CREG1O75629 220 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 BEST1O76090 585 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 G6PDP11413 515 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 BNC1Q01954 994 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CCNJQ5T5M9 372 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TLL1O43897 1013 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TIE1P35590 1138 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MAGEA2P43356 314 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SUOXP51687 545 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CREMQ03060 361 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 FAPQ12884 760 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 KIAA0040Q15053 153 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SNX20Q7Z614 316 aa21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SLC12A8A0AV02 714 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 DFFAO00273 331 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MUSKO15146 869 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TNFSF8P32971 234 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ARSDP51689 593 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CSNK2BP67870 215 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ELP6Q0PNE2 266 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 EFR3AQ14156 821 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 FBXL6Q8N531 539 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MARVELD3Q96A59 401 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 DUSP16Q9BY84 665 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 RLFQ13129 1914 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 OR5K3A6NET4 321 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CCL22O00626 93 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TFECO14948 347 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 KERAO60938 352 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SERPINA1P01009 418 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 HLA-DQB2P05538 268 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SOX6P35712 828 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 NKX3-2P78367 333 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 GMLQ99445 158 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 BEX2Q9BXY8 128 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ARNT2Q9HBZ2 717 aa21.3■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MSRB3Q8IXL7 192 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 OR4M1Q8NGD0 313 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 NETO1Q8TDF5 533 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PYURFQ96I23 114 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PITX2Q99697 317 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MMP28Q9H239 520 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 USP21Q9UK80 565 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ASB14A6NK59 587 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MAFKO60675 156 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CBLP22681 906 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CD83Q01151 205 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PLCZ1Q86YW0 608 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ENTHD1Q8IYW4 607 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CEP19Q96LK0 163 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ASAH2Q9NR71 780 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 DDIT4Q9NX09 232 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 OR51F1A6NGY5 319 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 LEUTXA8MZ59 168 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 WNT3AP56704 352 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 RAD51Q06609 339 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 LY6KQ17RY6 165 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TCTE3Q8IZS6 198 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa21.28■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms