RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 CER1O95813 267 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF806P0C7X5 589 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ERGP11308 486 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC2A4P14672 509 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHN1P15882 459 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ENGP17813 658 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TAC1P20366 129 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIST1H2ADP20671 130 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CYP2A7P20853 494 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ALDH3A1P30838 453 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 FASLGP48023 281 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HNMTP50135 292 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRKAA2P54646 552 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TTC23LQ6PF05 361 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 GPR156Q8NFN8 814 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 FBXL8Q96CD0 374 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 PKP4Q99569 1192 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 GAREM1Q9H706 876 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 IL21RQ9HBE5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARL15Q9NXU5 204 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 POLG2Q9UHN1 485 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 LAMA1P25391 3075 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 LNP1A1A4G5 178 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 A8MT66 165 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 PROB1E7EW31 1015 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TAPBPO15533 448 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRIM13O60858 407 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SDC3O75056 442 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SMIM24O75264 130 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC16A8O95907 504 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANXA6P08133 673 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANXA5P08758 320 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 MYL2P10916 166 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 IMPDH1P20839 514 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HSD17B2P37059 387 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATP1A2P50993 1020 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HERVK_113P63132 956 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SETDB1Q15047 1291 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 TCEA2Q15560 299 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CYP2A13Q16696 494 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 PFKFB4Q16877 469 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HHATQ5VTY9 493 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 LIPMQ5VYY2 423 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARL14Q8N4G2 192 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 AVL9Q8NBF6 648 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR56A3Q8NH54 315 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 UCK1Q9HA47 277 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 POT1Q9NUX5 634 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP249-201ENST00000365490 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms