RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 PTPN5P54829 565 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP8P85298 464 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IRF9Q00978 393 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EID2Q8N6I1 236 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PMEPA1Q969W9 287 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK15Q96Q40 435 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IL26Q9NPH9 171 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PNPOQ9NVS9 261 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.91□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 B4GALT2O60909 372 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MATN4O95460 622 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CER1O95813 267 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 BPGMP07738 259 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PRSS56P0CW18 603 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ACSL1P33121 698 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TPMTP51580 245 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CHRNB3Q05901 458 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC9A5Q14940 896 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TERF2Q15554 542 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ICE2Q659A1 982 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RNF43Q68DV7 783 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MREGQ8N565 214 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC9A6Q92581 669 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNJ9Q92806 393 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TPD52L3Q96J77 140 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CNDP1Q96KN2 507 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SYT11Q9BT88 431 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EBPLQ9BY08 206 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PSAT1Q9Y617 370 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PLIN3O60664 434 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IL4RP24394 825 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ACRV1P26436 265 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PIK3R1P27986 724 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 POU1F1P28069 291 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TAS2R50P59544 299 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SEMA3AQ14563 771 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CPTPQ5TA50 214 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RANBP10Q6VN20 620 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT73Q86Y46 540 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNN1Q92952 543 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLCO2A1Q92959 643 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 BOCQ9BWV1 1114 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RERGLQ9H628 205 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PREBQ9HCU5 417 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 HAO1Q9UJM8 370 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.9□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GTW7 788 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 WASH4PA8MWX3 477 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 C2orf74A8MZ97 194 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 GMFGO60234 142 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 UMPSP11172 480 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 AP2B1P63010 937 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 IRF4Q15306 451 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 LONP2Q86WA8 852 aa6.9□□□□□ -1.31
LRRTM3-201ENST00000361320 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms