RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8J3Q8NGG0 315 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FNDC8Q8TC99 324 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP3R2Q96LZ3 170 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF583Q96ND8 569 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 OARD1Q9Y530 152 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 INSL6Q9Y581 213 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 H0Y858 1186 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YAE9 185 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF1O95521 474 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GGT1P19440 569 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMK1Q14012 370 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO19Q96H55 970 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN7O95471 211 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GUCA1CO95843 209 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA6P08133 673 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DCKP27707 260 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FPGSQ05932 587 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RBFAQ8N0V3 343 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 VAPAQ9P0L0 249 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS21Q9Y6M0 314 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM64BA6NI03 449 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ATE1O95260 518 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RAP2AP10114 183 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC2A4P14672 509 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS4P49798 205 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ENTPD1P49961 510 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 AP1S1P61966 158 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC115Q96NT0 180 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB39AQ14964 217 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX20Q7Z614 316 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ITFG1Q8TB96 612 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB8Q9H765 288 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 LTBP2Q14767 1821 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ANTXRLA6NF34 631 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DFNA5O60443 496 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNH1O95259 989 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RHOP08100 348 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 NFATC2Q13469 925 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SMU1Q2TAY7 513 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 AADATQ8N5Z0 425 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CD244Q9BZW8 370 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GORASP2Q9H8Y8 452 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 IL26Q9NPH9 171 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BMQ9 156 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DGKAP23743 735 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GDF5P43026 501 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ARSFP54793 590 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL38P63173 70 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PLIN5Q00G26 463 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PTGR1Q14914 329 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PHKG1Q16816 387 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ELMOD1Q8N336 334 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GTF2H4Q92759 462 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 COG8Q96MW5 612 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PKD2L2Q9NZM6 624 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SPEGQ15772 3267 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GFRA2O00451 464 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS14O43566 566 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 HLCSP50747 726 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH3A2P51648 485 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCL1Q15111 1095 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms