RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ITGADQ13349 1161 aa18.27■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.27■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SCRN2Q96FV2 425 aa18.27■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.27■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.27■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.27■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CERS4Q9HA82 394 aa18.27■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 SAC3D1A6NKF1 404 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 GRIA3P42263 894 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 USP45Q70EL2 814 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 MARK4Q96L34 752 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 RNF112Q9ULX5 631 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 IQCF5A8MTL0 148 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 WASH3PC4AMC7 463 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 E5RI56 91 aa18.25■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 J3QRK9 145 aa18.25■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa18.25■□□□□ 0.51
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SPNS1-204ENST00000352260 CTRCQ99895 268 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 BOCQ9BWV1 1114 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 BTN3A1O00481 513 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 ACOX3O15254 700 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 NTRK1P04629 796 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-204ENST00000352260 GFAPP14136 432 aa18.24■□□□□ 0.51
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